Lo más frecuente es que la endometriosis este en el peritoneo pélvico y los ovarios, en forma de quistes llamados endometriomas. Pueden encontrarse lesiones en otras partes como el intestino, ligamentos úterosacros y menos frecuente en la vejiga. Hasta un 40% de las
pacientes que tienen endometriomas tienen focos en otros lugares. Los síntomas de cada paciente dan pistas de la localización de las lesiones.